食品發酵研究所
山東省食品發酵研究所主要研究領域集中在發酵法生產生物制品、農副產品深加工等領域。行業內率先將“果葡糖漿、黃原膠、衣康酸、人工培養冬蟲夏草、赤蘚糖醇、D-核糖、天然乳香香味劑、低聚木糖、木聚糖 、低聚麥芽糖、木糖（醇）、普魯蘭糖、可得然膠、韋蘭膠、葡萄糖酸鈉”等生物發酵制品以及一系列果蔬精深加工產品。如“濃縮棗汁等紅棗系列產品的深加工、山楂系列產品的深加工、水果蔬菜糧食發酵飲料、蘆筍下腳料綜合利用、蓮藕深加工技術”等推向產業化，創造了巨大的社會經濟效益。
山東省食品發酵工程行業技術中心（合作）
山東省食品發酵工程行業技術中心是我單位與山東輕工業學院合作，于2007年經山東省經濟貿易委員會批準成立。
山東省發酵行業的產品品種最多，產值超過2000億元，占全國的40%以上。中心主要研究涉及到食品發酵行業關鍵共性技術及食品新資源開發等領域。
山東省食品發酵工程泰山學者崗位 設崗單位
2013年9月，山東省人民政府批準山東省食品發酵工業研究設計院為泰山學者崗位設崗單位，授予我院劉建軍研究員為泰山學者特聘專家。
中小企業食品與發酵技術研發科技服務平臺由科學技術部科技型中小企業技術創新基金管理中心于二〇一四年七月批準成立，旨在為提高我國食品發酵行業中小企業的技術創新提供科技服務。
山東省食品企業質量與技術服務平臺
山東省食品企業質量與技術服務平臺是2016年元月經山東省中小企業局批準成立的省內中小企業公共服務示范平臺。
主要是針對省內內中小企業“產品安全檢測條件基礎薄弱”、“檢測檢驗技術能人員配備不足”、“食品安全檢測能力滯后”、“面向中小企業區域公共服務短缺”的不利因素而提出的解決方案，其目的主要是為山東省內食品生產企業特別是中小食品生產企業提供生產過程中影響食品安全因素的各種解決方案，從根源上把影響食品安全的各因素降低到最小程度。
